MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013851	TCC	2	6	46767	46772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939806
1003	NC_013851	TCG	2	6	46806	46811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1004	NC_013851	AGC	2	6	46824	46829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1005	NC_013851	CAC	2	6	46858	46863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939807
1006	NC_013851	CG	3	6	46867	46872	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1007	NC_013851	GCC	2	6	46886	46891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939807
1008	NC_013851	GCT	2	6	46945	46950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939807
1009	NC_013851	CG	3	6	47007	47012	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1010	NC_013851	CTG	2	6	47027	47032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939807
1011	NC_013851	GGC	2	6	47056	47061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939807
1012	NC_013851	CG	3	6	47098	47103	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1013	NC_013851	CG	3	6	47125	47130	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1014	NC_013851	GAG	2	6	47138	47143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939807
1015	NC_013851	CGTCG	2	10	47144	47153	0 %	20 %	40 %	40 %	288939807
1016	NC_013851	GCGT	2	8	47163	47170	0 %	25 %	50 %	25 %	288939807
1017	NC_013851	TCGAAG	2	12	47193	47204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288939807
1018	NC_013851	CGG	2	6	47293	47298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939807
1019	NC_013851	ATCC	2	8	47407	47414	25 %	25 %	0 %	50 %	288939808
1020	NC_013851	TCA	2	6	47428	47433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939808
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1022	NC_013851	GGT	2	6	47615	47620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939808
1023	NC_013851	CTG	2	6	47703	47708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1024	NC_013851	CGT	2	6	47714	47719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1025	NC_013851	GTCG	2	8	47816	47823	0 %	25 %	50 %	25 %	288939808
1026	NC_013851	CGGT	2	8	47869	47876	0 %	25 %	50 %	25 %	288939808
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1030	NC_013851	CTC	2	6	48002	48007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939808
1031	NC_013851	CGC	2	6	48011	48016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1032	NC_013851	CAT	2	6	48059	48064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939808
1033	NC_013851	CGC	2	6	48068	48073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1034	NC_013851	CGC	2	6	48077	48082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1035	NC_013851	CCG	2	6	48088	48093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
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1038	NC_013851	CGT	2	6	48228	48233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
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1040	NC_013851	TCT	2	6	48265	48270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939808
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1042	NC_013851	CG	4	8	48299	48306	0 %	0 %	50 %	50 %	288939808
1043	NC_013851	CAT	2	6	48380	48385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939808
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1046	NC_013851	GGT	2	6	48528	48533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939808
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1053	NC_013851	CGA	2	6	48764	48769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1054	NC_013851	AAG	2	6	48780	48785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939808
1055	NC_013851	GTC	2	6	48786	48791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1056	NC_013851	CCGC	2	8	48826	48833	0 %	0 %	25 %	75 %	288939808
1057	NC_013851	ACG	2	6	48874	48879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939808
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1109	NC_013851	CAT	2	6	51153	51158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939810
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1119	NC_013851	CGA	2	6	51708	51713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939811
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1123	NC_013851	GGGCA	2	10	51987	51996	20 %	0 %	60 %	20 %	288939812
1124	NC_013851	GCT	2	6	52049	52054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1125	NC_013851	GGC	3	9	52067	52075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939812
1126	NC_013851	GC	5	10	52074	52083	0 %	0 %	50 %	50 %	288939812
1127	NC_013851	TCG	2	6	52099	52104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1128	NC_013851	GC	3	6	52133	52138	0 %	0 %	50 %	50 %	288939812
1129	NC_013851	CGA	2	6	52148	52153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1130	NC_013851	AGC	2	6	52180	52185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1131	NC_013851	GGTGCT	2	12	52241	52252	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	288939812
1132	NC_013851	CGC	2	6	52318	52323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939812
1133	NC_013851	GGT	2	6	52394	52399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939812
1134	NC_013851	TCG	2	6	52405	52410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1135	NC_013851	CGA	2	6	52430	52435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1136	NC_013851	CG	3	6	52437	52442	0 %	0 %	50 %	50 %	288939812
1137	NC_013851	CTGG	2	8	52496	52503	0 %	25 %	50 %	25 %	288939812
1138	NC_013851	GAC	2	6	52515	52520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1139	NC_013851	GGC	2	6	52562	52567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939812
1140	NC_013851	GGA	2	6	52601	52606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939812
1141	NC_013851	TCA	2	6	52664	52669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939812
1142	NC_013851	GCGG	2	8	52738	52745	0 %	0 %	75 %	25 %	288939812
1143	NC_013851	GTC	2	6	52782	52787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1144	NC_013851	CG	3	6	52919	52924	0 %	0 %	50 %	50 %	288939812
1145	NC_013851	CGA	2	6	52967	52972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1146	NC_013851	TCG	2	6	52990	52995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1147	NC_013851	AAG	2	6	53001	53006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939812
1148	NC_013851	GCA	2	6	53023	53028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1149	NC_013851	ATC	2	6	53035	53040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939812
1150	NC_013851	TGG	2	6	53176	53181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939812
1151	NC_013851	GGCGCG	2	12	53196	53207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939812
1152	NC_013851	GTC	2	6	53226	53231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1153	NC_013851	CG	3	6	53233	53238	0 %	0 %	50 %	50 %	288939812
1154	NC_013851	GCCG	2	8	53243	53250	0 %	0 %	50 %	50 %	288939812
1155	NC_013851	GCTCAC	2	12	53255	53266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288939812
1156	NC_013851	GC	4	8	53267	53274	0 %	0 %	50 %	50 %	288939812
1157	NC_013851	GAC	2	6	53279	53284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939812
1158	NC_013851	GAA	2	6	53309	53314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939812
1159	NC_013851	TCG	2	6	53426	53431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939813
1160	NC_013851	CTG	2	6	53464	53469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939813
1161	NC_013851	CGG	2	6	53507	53512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939813
1162	NC_013851	CGG	2	6	53548	53553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939813
1163	NC_013851	CG	3	6	53571	53576	0 %	0 %	50 %	50 %	288939813
1164	NC_013851	CA	3	6	53629	53634	50 %	0 %	0 %	50 %	288939813
1165	NC_013851	GTCA	2	8	53683	53690	25 %	25 %	25 %	25 %	288939813
1166	NC_013851	CAT	2	6	53718	53723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939813
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1169	NC_013851	GC	3	6	53856	53861	0 %	0 %	50 %	50 %	288939813
1170	NC_013851	GCG	2	6	53908	53913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939813
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1180	NC_013851	GCGA	2	8	54400	54407	25 %	0 %	50 %	25 %	288939813
1181	NC_013851	TATCGC	2	12	54409	54420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288939813
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1201	NC_013851	GGA	2	6	55080	55085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939813
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1231	NC_013851	CG	3	6	56881	56886	0 %	0 %	50 %	50 %	288939814
1232	NC_013851	GCCA	2	8	56935	56942	25 %	0 %	25 %	50 %	288939814
1233	NC_013851	AGG	2	6	56972	56977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939814
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1235	NC_013851	GTCGC	2	10	57053	57062	0 %	20 %	40 %	40 %	288939814
1236	NC_013851	ATCC	2	8	57241	57248	25 %	25 %	0 %	50 %	288939814
1237	NC_013851	GC	3	6	57313	57318	0 %	0 %	50 %	50 %	288939814
1238	NC_013851	GGA	2	6	57327	57332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939814
1239	NC_013851	TTC	2	6	57346	57351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939814
1240	NC_013851	GCG	2	6	57412	57417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939814
1241	NC_013851	ACGTCG	2	12	57418	57429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288939814
1242	NC_013851	CTC	2	6	57431	57436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939814
1243	NC_013851	GCACCG	2	12	57460	57471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288939814
1244	NC_013851	CAG	2	6	57485	57490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939814
1245	NC_013851	CGC	3	9	57672	57680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939814
1246	NC_013851	CG	3	6	57711	57716	0 %	0 %	50 %	50 %	288939814
1247	NC_013851	CTG	2	6	57718	57723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939814
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1249	NC_013851	CCG	2	6	57785	57790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939814
1250	NC_013851	CGA	2	6	57934	57939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939815
1251	NC_013851	CCG	2	6	57945	57950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939815
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1254	NC_013851	GCCG	4	16	58364	58379	0 %	0 %	50 %	50 %	288939815
1255	NC_013851	GC	3	6	58381	58386	0 %	0 %	50 %	50 %	288939815
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1377	NC_013851	GAT	2	6	64989	64994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939822
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1499	NC_013851	CAA	2	6	71645	71650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939827
1500	NC_013851	CCG	2	6	71668	71673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939827

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